Это абсолютно безопасно. В облачной 1С работают даже государственные органы, у которых очень высокие требования к надежности. Более того, «облака» — безопаснее, чем локальные базы на компьютере. Если техника ломается или теряется, данные невозможно восстановить. В «облачной» 1С это исключено. Данные сохраняются в облаке и будут вам доступны в любом случае.
Что касается конфиденциальности данных: гораздо проще получить «доступ» к базе на компьютере, чем к надежно защищенному серверу фирмы «1С». Для подключения к нему используется безопасное соединение — HTTPS. Это значит, что ваши логины, пароли и данные шифруются, и не попадут к мошенникам. Сотрудники «1С», «АРБИС» или налоговой не имеют доступа к вашей 1С. Он есть только у вас и тех пользователей, которым вы даёте права. Конфиденциальность гарантируется договором.